J. A. Antanaitis gimė 1921 m. rugpjūčio 19 d. Pakruojo rajone, Rimšinių kaime. Tėvas ūkininkas daugelį metų buvo Pašvitinio valsčiaus viršaitis. Baigė Joniškio gimnaziją, 1939 m. įstojo į Vytauto Didžiojo universiteto Inžinerijos fakultetą, kurį 1944 m. baigė ir įgijo inžinieriaus statybininko specialybę.
1944 m. universitete pradėjo dėstyti statybos darbų organizavimą. Dar studijuodamas dalyvavo ateitininkų veikloje. Buvo 1941 m. birželio 23-iosios sukilimo dalyvis.
Nuo 1942 m. dalyvavo pogrindinėje Lietuvių fronto veikloje. 1944 m. rudenį buvo vienas iš Lietuvos išlaisvinimo tarybos iniciatorių. 1945 m. vasarą sovietinio saugumo suimtas ir nuteistas už politinę veiklą. Iki 1954 m. kalėjo šiaurėje, daugiausia Vorkutos specialaus režimo lageryje.
1957 m. sugrįžęs į Lietuvą dirbo projektuotoju, 1977-1995 m. – Pramonės statybos projektavimo instituto vyriausiasis konstruktorius.
J. A. Antanaitis buvo apdovanotas Vyčio Kryžiaus ordino Riterio kryžiumi, Kariuomenės kūrėjų savanorių medaliu, Lietuvos nepriklausomybės medaliu.
Reiškia užuojautą
Seimo pirmininkas Viktoras Pranckietis Seimo ir savo vardu reiškia nuoširdžią užuojautą laisvės kovotojo artimiesiems.
Kaip teigiama Seimo kanceliarijos pranešime, J. A. Antanaičio meilė tėvynei ir kovotojo dvasia yra pavyzdys jaunajai kartai.
Parlamento vadovas dėkojo J. A. Antanaičiui už veiklą, vedusią į laisvę ir nepriklausomybę, demokratijos ir tautinių vertybių puoselėjimą bei saugojimą.
J. A. Antanaitis apdovanotas Lietuvos nepriklausomybės medaliu, Vyčio Kryžiaus ordino Riterio Kryžiumi, Kariuomenės kūrėjų savanorių medaliu, Krašto apsaugos ministerijos medaliu „Už nuopelnus“.
